More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0120 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.03 
 
 
296 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  55.89 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  55.44 
 
 
296 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  55.78 
 
 
296 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  50.17 
 
 
295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  48.64 
 
 
302 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  52.33 
 
 
301 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  47.26 
 
 
283 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  45.15 
 
 
303 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  42.03 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  39.32 
 
 
293 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  42.21 
 
 
284 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  38.24 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  33.59 
 
 
294 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  35.75 
 
 
286 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  33.87 
 
 
285 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  33.87 
 
 
285 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  33.87 
 
 
285 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
306 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.03 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  35.03 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  28.52 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.65 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 
316 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
290 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  34.43 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.43 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  33.19 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  33.54 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  36.1 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  37.82 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.33 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  26.45 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.15 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.23 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  30.23 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  37.14 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.97 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  30.36 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  29.77 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  30.66 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.93 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.96 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  31.37 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  30.59 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  28.22 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  28.22 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  28.22 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  29.06 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.86 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.18 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.41 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.06 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  35.67 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  28.71 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.67 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.23 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  32.16 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  30.34 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  30.23 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  30.34 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  25.38 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  30.34 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  28.35 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.18 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  29.05 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  37.76 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  29.19 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.06 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  30.41 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  29.19 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  29.44 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  38.1 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  26.72 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>