More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1503 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  86.69 
 
 		 293 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  42.03 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  42.52 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  43.54 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  39.38 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  44 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  42.24 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  39.26 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  37.59 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  42.52 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  48.36 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.54 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  32.91 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  32.91 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  32.19 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  28.67 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  28.67 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  28.67 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.8 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.29 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.29 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  27.83 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  32.13 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  29.88 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.6 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.82 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  36.42 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  35.96 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  32.13 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  32.29 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  32.29 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  32.29 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  34.91 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  35.04 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  32.6 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  27.68 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  30.94 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.99 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  32.63 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  31.37 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  26.37 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  34.01 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  31.36 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  26.03 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  31.25 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  26.03 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  31.84 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  31.84 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  26.03 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  33.91 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  26.03 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  30.2 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  26.03 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.6 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  28.42 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  33.7 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.34 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.73 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  29.17 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.5 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.52 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.93 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  26.8 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  24.71 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  27.92 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  29.69 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  26.01 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.42 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  28.11 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.94 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.39 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  31.33 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  31.63 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  29.39 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  29.39 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.8 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>