More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
293 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  55.89 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.9 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  53.77 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  53.08 
 
 
296 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  50.34 
 
 
302 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  47.47 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  51.67 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  44.98 
 
 
283 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  41.72 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  42.24 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  39.86 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  43.75 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 
287 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  32.86 
 
 
285 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.86 
 
 
285 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.86 
 
 
285 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.79 
 
 
306 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  32.38 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  31.87 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  33.68 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.45 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  32.02 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  33.46 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 
281 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
343 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  35.8 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  40.88 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  33.81 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  31.58 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.72 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  30.88 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.67 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  28.43 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.37 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.44 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  30.33 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  34.72 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  37.85 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.37 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  35.48 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  37.5 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.1 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.22 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.72 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.57 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.31 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.33 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.81 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  33.33 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  33.33 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.47 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.39 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  32.34 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  30.39 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  32.34 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  30.39 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  32.34 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  34.88 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.83 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  30.77 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  31.84 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.16 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.8 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.52 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.17 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  36.93 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  39.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  27.87 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.54 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  29.41 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  28.24 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  33.88 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  32.2 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  30.22 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  30.8 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.54 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>