More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1109 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  100 
 
 
368 aa  771    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  34.42 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  34.42 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  33.95 
 
 
391 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  29.78 
 
 
372 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  28.95 
 
 
381 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  32.92 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  33.49 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.23 
 
 
415 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  25.81 
 
 
319 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.06 
 
 
337 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
343 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  29.54 
 
 
380 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  24.58 
 
 
322 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
287 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 
326 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.25 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.5 
 
 
307 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.86 
 
 
323 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.57 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.23 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 
281 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  30.4 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  23.73 
 
 
309 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.5 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.25 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.02 
 
 
310 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.91 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  23.28 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  27.27 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.22 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.72 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.77 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  32.73 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.13 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.08 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.52 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
296 aa  92.8  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  25.68 
 
 
321 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.9 
 
 
318 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 
305 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
311 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.16 
 
 
339 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  25.2 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.5 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.79 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.06 
 
 
328 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  26.08 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  26.88 
 
 
316 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
314 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
308 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  24.22 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  24.22 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  24.22 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  23.69 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.68 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
531 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.58 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  27.34 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
345 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
328 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  28.94 
 
 
335 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.33 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.78 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  31.58 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.77 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.92 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  28.72 
 
 
292 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  27.11 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  23.73 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  23.78 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  24.56 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  22.76 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  25.96 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.11 
 
 
507 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.07 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.21 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  31.64 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.09 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  24.56 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.77 
 
 
277 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  24.72 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.14 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  23.14 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  22.59 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  29.47 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  27.46 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  25.83 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  23.78 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.57 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  22.8 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.84 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>