More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3206 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
346 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  80 
 
 
345 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  62.72 
 
 
348 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  62.72 
 
 
342 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.17 
 
 
346 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  59.6 
 
 
344 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  59.21 
 
 
346 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  57.89 
 
 
346 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  56.85 
 
 
345 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  56.27 
 
 
346 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  57.88 
 
 
351 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  55.15 
 
 
349 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  55.15 
 
 
349 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  55.15 
 
 
349 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  57.19 
 
 
342 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  53.31 
 
 
349 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  53.31 
 
 
349 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  52.41 
 
 
354 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  51.85 
 
 
355 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  48.35 
 
 
344 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.12 
 
 
339 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  47.06 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  47.58 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  47.94 
 
 
349 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.88 
 
 
352 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  45.02 
 
 
350 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  44.71 
 
 
350 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  44.31 
 
 
352 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  44.41 
 
 
343 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  49.69 
 
 
341 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  43.75 
 
 
343 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  43.75 
 
 
343 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  44.28 
 
 
347 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  43.75 
 
 
343 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  44.11 
 
 
343 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  43.58 
 
 
344 aa  255  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  45.37 
 
 
345 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  49.38 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  45.6 
 
 
343 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  48.28 
 
 
372 aa  252  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.71 
 
 
351 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  43.12 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  46.11 
 
 
346 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  42.09 
 
 
339 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  42.14 
 
 
361 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  41.12 
 
 
372 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  42.69 
 
 
350 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  43.99 
 
 
346 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.79 
 
 
333 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.33 
 
 
336 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.06 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.03 
 
 
334 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.9 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.68 
 
 
326 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 
335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.57 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.52 
 
 
341 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.62 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.41 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.33 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.09 
 
 
322 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.27 
 
 
357 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  33.07 
 
 
346 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
318 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.62 
 
 
349 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.28 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  29.43 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.67 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.03 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.33 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.01 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.81 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.49 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.42 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.49 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.49 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  27.83 
 
 
353 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.39 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  30.98 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  27.76 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  29.78 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  27.11 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  38.14 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  26.8 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.95 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  31.15 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  25.4 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  26.65 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.76 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>