More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3612 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  100 
 
 		 342 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  62.72 
 
 		 346 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  63.19 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  57.94 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  57.82 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  54.23 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  54.91 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  55 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  52.35 
 
 		 346 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  52.35 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  53.12 
 
 		 342 aa  349  5e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  50.59 
 
 		 349 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  50.59 
 
 		 349 aa  345  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  50.59 
 
 		 349 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  51.9 
 
 		 351 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  48.55 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  48.55 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  48.98 
 
 		 354 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  49.14 
 
 		 355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  44.57 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  45.59 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  41.23 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  40.85 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.82 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  39.94 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  40.86 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  42.22 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.67 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  43.47 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  43.77 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.9 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.31 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  42.69 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  39.52 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  42.41 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  38.08 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  38.8 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  38.55 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  38.55 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  38.55 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  39.27 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  39.65 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  38.58 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  41.25 
 
 		 346 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.18 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.32 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.67 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.65 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  27.42 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.81 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  32.5 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.53 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.43 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.84 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  31.47 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  34.36 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  32.84 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.96 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  39.47 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  26.28 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.12 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.51 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.4 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.97 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.69 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.48 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.51 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  31.79 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.49 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  30.26 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  30.26 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  30.26 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.19 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  29.03 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.66 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  32.32 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  24.84 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  25.65 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  25.65 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.65 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  30.68 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  30.43 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  26.82 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.88 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  30.08 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  30.08 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  24.4 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  30.08 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  30.54 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  33.62 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.63 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  30 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>