More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2018 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  100 
 
 
347 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  97.67 
 
 
348 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  89.44 
 
 
348 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  89.15 
 
 
347 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  89.15 
 
 
348 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  59.77 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  49.12 
 
 
364 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  37.54 
 
 
347 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.71 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.73 
 
 
318 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.5 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  33.04 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  31.38 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.57 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  30.58 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.53 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.77 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.08 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.52 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.49 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.52 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.52 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  25.75 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.21 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  27.21 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  25.75 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  25.75 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.01 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  26.76 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  29.1 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.64 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.77 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.62 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  30.49 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.56 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.95 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.17 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.23 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.77 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.81 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  26.18 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  26.23 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  25.39 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.14 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
754 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  26.53 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  26.53 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 
764 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.98 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.99 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  25.11 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.73 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 
301 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  26.19 
 
 
391 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.79 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  33.13 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  28.04 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.8 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.61 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  27.87 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.05 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.66 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.6 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.85 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  28 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  27.8 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.85 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  28 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.05 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  25.85 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.48 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  25.49 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  25.45 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.71 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  28.31 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  29.75 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.96 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  26.94 
 
 
293 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  26.8 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.97 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.16 
 
 
346 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.24 
 
 
311 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  26.67 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  32.64 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6112  Luciferase-like monooxygenase  26.83 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385771  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>