More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1121 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  100 
 
 
341 aa  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  92.92 
 
 
342 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  64.81 
 
 
342 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  59.41 
 
 
341 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  45.54 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  47.15 
 
 
340 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  45.89 
 
 
343 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  44.55 
 
 
335 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  43.48 
 
 
348 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  45.12 
 
 
352 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  40.71 
 
 
340 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  44.52 
 
 
364 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.05 
 
 
349 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  42.35 
 
 
325 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  40.52 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  40.37 
 
 
327 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  40.37 
 
 
327 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  40.06 
 
 
327 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  39.87 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  40.2 
 
 
341 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  40.67 
 
 
333 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  39.54 
 
 
338 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  39.54 
 
 
338 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  36.28 
 
 
345 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  40.06 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  33.33 
 
 
349 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  33.33 
 
 
349 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  33 
 
 
349 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  33.55 
 
 
340 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  33.55 
 
 
340 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.55 
 
 
340 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  31.88 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.27 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  33 
 
 
326 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.41 
 
 
331 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.8 
 
 
336 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.81 
 
 
328 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.08 
 
 
333 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.28 
 
 
334 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.48 
 
 
339 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 
318 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.18 
 
 
328 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.52 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  29.96 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.17 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.03 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  31.23 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.63 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  28.34 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  29.93 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.34 
 
 
350 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.37 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  28.97 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  29.32 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.82 
 
 
343 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.2 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  29.15 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  29.15 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  29.15 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.27 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.3 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.35 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  36.55 
 
 
153 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.62 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27.23 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  29.85 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  26.94 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  27.49 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  27.23 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  26.94 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  26.94 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  26.85 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  31.82 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.68 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  28.67 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  28.23 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.77 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.17 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.6 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  31.17 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.03 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  31.97 
 
 
301 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  27.53 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.54 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.34 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>