182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4043 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 333 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  71.47 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  70.27 
 
 		 333 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.02 
 
 		 341 aa  297  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.96 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  42.69 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  42.65 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  40.12 
 
 		 383 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  39.83 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.37 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  41.92 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.7 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.82 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.5 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.76 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.45 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.92 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.43 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.43 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.22 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.52 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.31 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.16 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.71 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.72 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.72 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.97 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  23.9 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.41 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.42 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.63 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  21.71 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  23.81 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  30.65 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  26.79 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.47 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.28 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.35 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  23.6 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  31 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.33 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  31.36 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  23.68 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.2 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  24.19 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  24.04 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  25.54 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  27.84 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.36 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  23.91 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  25.66 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  23.19 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  21.97 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  23.56 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.99 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.09 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  28.9 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  26.7 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.93 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.67 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.09 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  23.39 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  28.93 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.32 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.71 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  27.37 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  22.61 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  24.17 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  22.12 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  22.29 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  25.21 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  23.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  23.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  23.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  22.53 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  22.19 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  22.19 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  22.19 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  29.88 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  27.93 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  23.55 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  22.03 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  25.93 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.03 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>