More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0972 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  100 
 
 
342 aa  681    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  42.86 
 
 
364 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0532  luciferase-like protein  33.43 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  34.43 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  34.03 
 
 
335 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 
374 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.95 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.75 
 
 
346 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  30.43 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.31 
 
 
346 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.16 
 
 
344 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.84 
 
 
344 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  32.53 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
336 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.24 
 
 
353 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.6 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.41 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  29.06 
 
 
337 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.81 
 
 
331 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  29.91 
 
 
376 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.72 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.15 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.56 
 
 
333 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
364 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 
343 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.91 
 
 
360 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.13 
 
 
347 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  31.58 
 
 
341 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.46 
 
 
372 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.43 
 
 
347 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 
348 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.81 
 
 
362 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
362 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.85 
 
 
355 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.63 
 
 
365 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.13 
 
 
334 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.6 
 
 
345 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  28.31 
 
 
361 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.93 
 
 
307 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 
341 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  28.74 
 
 
333 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  31.4 
 
 
340 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  28.99 
 
 
405 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  23.8 
 
 
363 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.98 
 
 
345 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  26.94 
 
 
330 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 
329 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  42.24 
 
 
278 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.75 
 
 
305 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  27.47 
 
 
362 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  32.47 
 
 
341 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.95 
 
 
335 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.65 
 
 
352 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.19 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  32.62 
 
 
293 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.45 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  26.56 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.84 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  28.89 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.34 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.08 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.08 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.24 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.83 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.32 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.44 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.91 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.91 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  40.65 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.77 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  36.5 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.69 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  40.6 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  29.15 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  38.41 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  38.41 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  38.41 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.27 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.17 
 
 
347 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  27.64 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  36.9 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.36 
 
 
283 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.36 
 
 
283 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  26.1 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  31.53 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  31.53 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.77 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
376 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.36 
 
 
283 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  31.53 
 
 
293 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.7 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  31.25 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>