More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2345 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  100 
 
 		 304 aa  589  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  69.57 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  55.52 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  51.34 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.52 
 
 		 298 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  46.46 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  49.49 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  44.77 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  42.09 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  42.09 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  42.09 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  40.88 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  40.82 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  45.83 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  44.15 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  45.45 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  44.41 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  40.51 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  44.01 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  44.93 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  44.93 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  44.93 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  40.13 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  41.8 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  39.07 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  39.07 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  42.91 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  38.41 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  42.12 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  37.54 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  37.54 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  37.11 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  32.19 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.16 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.95 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  31.23 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  31.21 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  32.48 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.21 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  32.12 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  32.12 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  31.17 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.33 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 		 372 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.63 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.12 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  30.99 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  30.51 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  31.17 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  31.17 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.13 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.52 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.41 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  32.28 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.51 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.73 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.33 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  27.96 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  30.09 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  28.27 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.15 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  33.02 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.31 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.75 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  30.43 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  30.43 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  29.17 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  31.4 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.43 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  30 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.54 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.13 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  30.9 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33050  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.28 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166374  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.37 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.26 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.73 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  25.15 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.15 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.15 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  27.6 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  29.06 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  27.62 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  31.33 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>