244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3260 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  74.92 
 
 		 304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  70.3 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  64.56 
 
 		 309 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  60.13 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  60.13 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  59.48 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  55.56 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  42.16 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.3 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  40.19 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  43.51 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  44.15 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  39.5 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  42.63 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  42.63 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  42.63 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  38.92 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  41.19 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  39.25 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  37.78 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  37.78 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  37.78 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  42.63 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  37.97 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.94 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  40.88 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  40.28 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  43.59 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  41.79 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  35.22 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  56.43 
 
 		 143 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  34.11 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.3 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.49 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.3 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  27.92 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  27.27 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  28.1 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0415  luciferase family protein  55.06 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  31.22 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  24.56 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.87 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  31.06 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  29.96 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  31.65 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  29.7 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  31.65 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  26.45 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.96 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.35 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  30.26 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33050  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.21 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166374  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.72 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  30.61 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.62 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  29.47 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  31.15 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  27.45 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.71 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.87 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.65 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.47 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.25 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.25 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.25 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  25.21 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  27.86 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.76 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  26.38 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.1 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.51 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.28 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  23.88 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.63 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  31.3 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.13 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.64 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  25.76 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  30.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  28.45 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.43 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  28.93 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>