30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0415 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0415  luciferase family protein  100 
 
 
91 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  60.67 
 
 
304 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  58.43 
 
 
304 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  58.06 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  53.26 
 
 
309 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  53.26 
 
 
309 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  55.06 
 
 
304 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  53.26 
 
 
300 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  52.17 
 
 
309 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  69.44 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  47.89 
 
 
318 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  43.18 
 
 
318 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  43.18 
 
 
318 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  43.18 
 
 
318 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  45.07 
 
 
318 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  42.86 
 
 
317 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  41.38 
 
 
311 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  40 
 
 
318 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  45.83 
 
 
317 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 
301 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  35.62 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  35.62 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  35.62 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  35.62 
 
 
318 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  34.25 
 
 
318 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  42.05 
 
 
301 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  37.1 
 
 
329 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  40.28 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.1 
 
 
298 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  41.94 
 
 
283 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>