40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0705 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  276  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  61.43 
 
 		 304 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  62.86 
 
 		 309 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  56.43 
 
 		 304 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  57.14 
 
 		 304 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  50.71 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  50.71 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  50 
 
 		 309 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  42.96 
 
 		 318 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  42.96 
 
 		 318 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  42.96 
 
 		 318 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  43.66 
 
 		 318 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  42.96 
 
 		 318 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  46.85 
 
 		 318 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  45.77 
 
 		 318 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  45.52 
 
 		 317 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  44.06 
 
 		 318 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  45.71 
 
 		 300 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  44.83 
 
 		 318 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  44.83 
 
 		 318 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  44.83 
 
 		 318 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  46.1 
 
 		 317 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  45 
 
 		 311 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  41.43 
 
 		 301 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  50.85 
 
 		 296 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  43.59 
 
 		 309 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  39.44 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  37.93 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  45.07 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 329 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0415  luciferase family protein  59.46 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.03 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  41.94 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  36.29 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  34.65 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  29.75 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33050  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 367 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166374  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>