234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5022 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  94.82 
 
 
309 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  80.58 
 
 
300 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  65.25 
 
 
309 aa  359  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  62.09 
 
 
304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  59.28 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  60.13 
 
 
304 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  38.68 
 
 
318 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  41.64 
 
 
318 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  40.31 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  38.17 
 
 
318 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  38.17 
 
 
318 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  38.17 
 
 
318 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  38.36 
 
 
318 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  38.98 
 
 
311 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  39.54 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  39.75 
 
 
318 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  39.75 
 
 
318 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  39.75 
 
 
318 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  37.54 
 
 
318 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.05 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 
301 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  38.49 
 
 
317 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.66 
 
 
302 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  39.07 
 
 
304 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  37.19 
 
 
296 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  37.81 
 
 
317 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
301 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  38.74 
 
 
283 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  50.71 
 
 
143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  31.96 
 
 
306 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  30.6 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
329 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.31 
 
 
333 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.89 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.64 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.87 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.71 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  30 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.17 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.44 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.93 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.12 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  28.37 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.95 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.03 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  28.01 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.36 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  30.59 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  29.56 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33050  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.3 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166374  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.44 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.35 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  29.47 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.05 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.93 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.98 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  28.99 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  29.89 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0415  luciferase family protein  55.41 
 
 
91 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.14 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  25.37 
 
 
351 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  29.44 
 
 
338 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.04 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.98 
 
 
352 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.47 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.36 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  25.71 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  28.85 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  23.32 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  32.13 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  23.71 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.3 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  26.91 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  21.71 
 
 
344 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  29.1 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  22.63 
 
 
348 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  29.03 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  29.03 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 
327 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  29.09 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  32.24 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  33.33 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  24.56 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  28.87 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  27.55 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25.39 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25.39 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.05 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  25.81 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  24.72 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  30.58 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.18 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.27 
 
 
361 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>