More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3804 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  100 
 
 
318 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  100 
 
 
318 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  72.56 
 
 
317 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  72.7 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  69.18 
 
 
318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  64.44 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  54.4 
 
 
318 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  52.23 
 
 
318 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  52.23 
 
 
318 aa  329  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  50.96 
 
 
318 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  44.34 
 
 
304 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  42.27 
 
 
304 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.92 
 
 
302 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  43.08 
 
 
304 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  41.33 
 
 
311 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  41.3 
 
 
309 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  44.93 
 
 
304 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  43.14 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  39.75 
 
 
309 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  39.75 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  39.75 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  41.01 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.72 
 
 
298 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  44.22 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  42.36 
 
 
301 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  36.82 
 
 
309 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  37.19 
 
 
300 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  41.73 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  34.14 
 
 
306 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0705  hypothetical protein  44.83 
 
 
143 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
329 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.69 
 
 
360 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.76 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  29.11 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.32 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  33.45 
 
 
321 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  29.12 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.55 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  36.06 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.12 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.72 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.48 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  32.13 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  34.76 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.79 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  31.64 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.62 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  29.87 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.13 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  25.31 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  27.81 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.52 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.5 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.91 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.92 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  39.51 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.3 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  30.6 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  32.65 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  34.44 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  31.55 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  31.71 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.91 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  27.24 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  30.48 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  28.31 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  28.01 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.68 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.3 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  32.93 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.83 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  32.93 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  31.68 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  32.43 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.44 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  32.43 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.22 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  32.43 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  32.34 
 
 
391 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  32.78 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.49 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  34.93 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>