175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33050  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
367 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166374  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0203  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  50 
 
 
320 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  33.45 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  35.9 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  32.19 
 
 
306 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.65 
 
 
302 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7087  luciferase family protein  31.98 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  34.89 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  35.08 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  35.06 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  36.51 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  31.56 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.68 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  30.04 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  29.6 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  36.06 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.6 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.6 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.6 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  29.14 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  33.76 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.13 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  28.64 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.34 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.07 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  35.48 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.21 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.21 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  30.91 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  30.55 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  30.55 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 
283 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0517  luciferase family protein  33.53 
 
 
304 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  30.77 
 
 
318 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.46 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  28.46 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  29.24 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  35.31 
 
 
314 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  31.53 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  29.01 
 
 
343 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  30.22 
 
 
318 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  30.22 
 
 
318 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  30.22 
 
 
318 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  29.3 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  31.82 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3397  Alkanesulfonate monooxygenase  32.35 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  29.41 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.6 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.44 
 
 
327 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.75 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.75 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.75 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  28.86 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.44 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  31.74 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  31.74 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.74 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  28.28 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.85 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.81 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  30.43 
 
 
355 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  28.12 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  26.62 
 
 
342 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  27.67 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  29.45 
 
 
349 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  29.45 
 
 
349 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  28.66 
 
 
348 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  29.45 
 
 
349 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.47 
 
 
345 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  32.07 
 
 
346 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.22 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.63 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  25.62 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.78 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.08 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  28.75 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.82 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  35.09 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.32 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.15 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  30.73 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  27.74 
 
 
304 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.67 
 
 
352 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  30 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  28.42 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
557 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.66 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  29.05 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>