More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3016 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  96.95 
 
 
296 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  57.99 
 
 
288 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  49.46 
 
 
288 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  49.12 
 
 
298 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  48.75 
 
 
305 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  48.24 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  43.25 
 
 
293 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  39.05 
 
 
278 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.07 
 
 
307 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  41.53 
 
 
272 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.04 
 
 
299 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.29 
 
 
288 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  36.51 
 
 
291 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  39.6 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  36.18 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  36.1 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  36.32 
 
 
289 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  33.17 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  34.41 
 
 
341 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.62 
 
 
339 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  42.35 
 
 
278 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.21 
 
 
291 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  33.87 
 
 
299 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 
286 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  31.96 
 
 
293 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  31.96 
 
 
293 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.21 
 
 
293 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  31.96 
 
 
293 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.41 
 
 
293 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  37.08 
 
 
324 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  40.84 
 
 
308 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  39.32 
 
 
308 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  39.32 
 
 
308 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.33 
 
 
299 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  36.15 
 
 
285 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32 
 
 
337 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  37.09 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  34.31 
 
 
306 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  35.78 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.29 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  35.6 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  34.29 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  34.29 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  37.56 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.36 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.88 
 
 
285 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  44.87 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  38.76 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  35.68 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.46 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  32.38 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  36.52 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.04 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
754 aa  92  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.2 
 
 
285 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.35 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  29.86 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  45.3 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  36.65 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  36.65 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  36.65 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.25 
 
 
315 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.18 
 
 
306 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.42 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  40.58 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  40.58 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  33.66 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  40.58 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  35.56 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  34.43 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.92 
 
 
292 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  40.99 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  36.67 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.15 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  35.2 
 
 
753 aa  85.9  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  38.85 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  36.72 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  37.78 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.98 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  33.5 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.43 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 
543 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.68 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.68 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  34.68 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  37.16 
 
 
557 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.26 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  37.12 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.32 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  37.14 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  32.21 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>