More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2634 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  100 
 
 		 290 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  89.27 
 
 		 290 aa  534  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  61.54 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  61.54 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  61.54 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  44.67 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  42.07 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  42.41 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.83 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  41.72 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  41.72 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.46 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  43.25 
 
 		 288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  37.59 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  37.8 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  38.1 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  36.84 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  37.59 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.74 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  34.39 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.78 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.98 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  36.28 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.24 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.6 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  40.82 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.43 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.13 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  38.43 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  38.43 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  38.43 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.4 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  33.82 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.37 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  38.33 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  38.51 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.34 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  31.82 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  35.08 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.83 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  31.82 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  38.12 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.24 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  32 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.55 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.55 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.55 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  28.9 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.37 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.7 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28.18 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.53 
 
 		 339 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.76 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  33.33 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.87 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.84 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  32.8 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  30.47 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  36.18 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  27.05 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.29 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  37.04 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.82 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.07 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.37 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  27.74 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  35.07 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  31.85 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.29 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.68 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  27.05 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  27.16 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.65 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.09 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  25.13 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  25.6 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  30.05 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  31.64 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  32.07 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  26.51 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  28.28 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  30.11 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>