More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4654 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 326 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  87.65 
 
 		 325 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  75.08 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  73.77 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  73.77 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  73.77 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  72.13 
 
 		 319 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  72.13 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  71.7 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  72.94 
 
 		 313 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  54.52 
 
 		 313 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  45.31 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  44.04 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  39.5 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  39.74 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  38.75 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  39.6 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  39.23 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  37.46 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  37.13 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  37.13 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  36.81 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  36.81 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  37.13 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  34.59 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  37.85 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  39.5 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  36.31 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40.19 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.87 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  36.42 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  37.18 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  36.99 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  38.79 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  34.2 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  32.9 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  35.79 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  38.08 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  37.59 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  37.59 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  37.59 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  33.85 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  32.62 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  31.75 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  34.41 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.76 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  40.37 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  38.89 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.83 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.96 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  37.17 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.93 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.49 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.63 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.63 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.07 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  36.28 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  42 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  35.58 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  38.61 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  38.61 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  40 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.63 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.74 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  31.61 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.76 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.96 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  28.93 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.64 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  28.93 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  37.96 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  28.21 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  28.93 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.34 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  27.27 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  27.27 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  30.6 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  29.53 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  27.27 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  38.1 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  31.22 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>