More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01680 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  50.65 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  50.32 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  48.38 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  47.4 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  46.75 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  46.2 
 
 		 314 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  46.84 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  45.25 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  40.73 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  46.01 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  44.38 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  46.64 
 
 		 313 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  42.41 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  46.56 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  45.74 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  44.79 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  43.53 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  40.31 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  40.51 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  40.51 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  40.51 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  40.51 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  40.51 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  44.84 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  39.61 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  43.65 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  46.86 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  45.95 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  45.95 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  45.95 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  44.34 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  40.94 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  45.31 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  44.98 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  42.05 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  45.21 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  41.24 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  42.99 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  44.44 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  42.31 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  40.84 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  38.36 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  36.65 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  40.93 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  40.57 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  39.86 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  39.86 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  39.86 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  35.76 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.05 
 
 		 272 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  36.02 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.99 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18420  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.61 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.86 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.61 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.61 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  35.29 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  35.1 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.23 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  25.08 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  32.61 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.46 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  33.16 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.64 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  34.62 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  25.54 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  28 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.07 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.49 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.13 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  32.65 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  33.11 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  29.56 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  26.87 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.49 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30.81 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.08 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  34.48 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  34.29 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.89 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  31.76 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  31.76 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  31.76 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  29.41 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  31.76 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.48 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.16 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.55 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  31.65 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.55 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>