More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02793 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  100 
 
 		 302 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  61.31 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  60.86 
 
 		 316 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  61.31 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  61.72 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  61.72 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  47.52 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  38.21 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  36.04 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  34.31 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  36.65 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  37.14 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  37.13 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  37.05 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  41.24 
 
 		 339 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  40.15 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  35.48 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  38.91 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  39.11 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  36.43 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  35.36 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  32.6 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  32.48 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  32.48 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  34.98 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  32.48 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  35.97 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  32.48 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  32.15 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  32.15 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  36.79 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  34.93 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.03 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  31.35 
 
 		 322 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  34.05 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  35.23 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  32.35 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  33.01 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  32.27 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  32.47 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  32.38 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  32.38 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  32.38 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  31.05 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  30.95 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  23.27 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.95 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.41 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.82 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  28.8 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  34.21 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.28 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.81 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  29.07 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.59 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  25.61 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  29.25 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  24.3 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.24 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  28.67 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  28.67 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.29 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  29.41 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.33 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.32 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.03 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  29.59 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  28.87 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  25.73 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  25.73 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  25.73 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  23.86 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.95 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.87 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  27.67 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  33.08 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.13 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.42 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  27.22 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  27.05 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  39.53 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.65 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>