More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5536 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  100 
 
 		 313 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  76.72 
 
 		 319 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  75.74 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  75.74 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  75.74 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  74.84 
 
 		 319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  72.96 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  72.31 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  72.94 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  72.08 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  52.49 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  45.28 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  39.09 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  40.76 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  40.06 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  39.17 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  39.34 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  43.71 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  39.1 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  36.05 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  38.3 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  36.93 
 
 		 317 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  36.6 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  36.27 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  36.27 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.6 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  40.19 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  40.19 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  40.26 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  33.12 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40.51 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  37.03 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  38.36 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  38.78 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.84 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  39.31 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  39.31 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  38.01 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  37.38 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  33.11 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.14 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  41 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  37.01 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  35.19 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  35.71 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  32.68 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  35.76 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  32.79 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  28.67 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.28 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  37.07 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.91 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.14 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  29.66 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.6 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.95 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.43 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  30.6 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  34.75 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  34.97 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.4 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  31.4 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  31.78 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.52 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  33.51 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.5 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.05 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  31.41 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  28.4 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4450  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.04 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.743649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6045  hypothetical protein  27.43 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0597189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.3 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  25.42 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.27 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.38 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.12 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.49 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.64 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.67 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  35.96 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.49 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.46 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  28.42 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.49 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  30.37 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.03 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>