More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4450 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4450  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
286 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.743649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.25 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  48.46 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  40.74 
 
 
293 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  44.7 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  45.32 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  42.74 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  36.52 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  39.84 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  37.59 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  35.46 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  37.59 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  37.59 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  43.22 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  44.14 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  40.68 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  40.54 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  36.36 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.44 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  32.69 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  45.05 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  35.17 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.3 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.14 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  41.18 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  41.44 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  41.44 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  41.51 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  38.46 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  38.06 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  38.06 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  39 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  34.17 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  34.17 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  34.17 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  34.17 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  34.17 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  38.26 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  34.71 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  34.17 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  38.74 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  41.44 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.13 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  38.14 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  39.5 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.74 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  41.51 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.16 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.43 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  45.05 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  41.44 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  37.91 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  40.38 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  45.05 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  45.05 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  37.27 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  38.28 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.82 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.81 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  37.25 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  41.07 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  35.88 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  33.61 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  45.05 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  35.57 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  35.57 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  38.89 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  35.57 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  28.33 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  34.62 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  34.45 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.3 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  38.39 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  39 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  43.24 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  39.64 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  34.78 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  41.44 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.35 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  34.71 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  39.6 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  35.53 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  40.54 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  40.57 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  36.52 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  31.16 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.44 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  33.04 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  30.83 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>