More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0001 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  47.32 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  46.49 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  46.64 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  46.67 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  45.25 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  46.89 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  46.1 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  40.73 
 
 		 319 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  42.02 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  42.02 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  41.69 
 
 		 320 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  41.69 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  41.69 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  41.37 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  41.39 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  38.93 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  38.8 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  38.59 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  36.7 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  35.31 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  40.64 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.74 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.01 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  37.92 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  35.92 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  35.6 
 
 		 346 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  36.79 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  35.05 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  35 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  34.78 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  34.21 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  33.55 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  33.55 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  33.66 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  33.55 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  32.58 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  31.13 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  34.05 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  34.05 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  34.05 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  31.39 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  32.69 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.8 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  33.33 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.8 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.8 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.8 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.27 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.68 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  25.44 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  28.02 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.31 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  28.44 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.58 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.4 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.86 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27.65 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.2 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.07 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.97 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.57 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  28.18 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.89 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  29.57 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.37 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.38 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.37 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.89 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.07 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  23.73 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.02 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.12 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  24.31 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  22.71 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.19 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5777  luciferase family protein  24.92 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.61 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  23.74 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  22.46 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  28.99 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.5 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  32.48 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.23 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>