More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0928 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
325 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  87.65 
 
 
326 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  74.84 
 
 
319 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  73.53 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  73.53 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  73.53 
 
 
319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  71.7 
 
 
321 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  71.7 
 
 
319 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  72.7 
 
 
319 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  72.96 
 
 
313 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  54.43 
 
 
313 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  44.34 
 
 
319 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  43.35 
 
 
311 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  38.08 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  38.74 
 
 
327 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  39.87 
 
 
314 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  38.98 
 
 
327 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  39.22 
 
 
342 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  38.16 
 
 
327 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  36.48 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  35.13 
 
 
320 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  36.16 
 
 
317 aa  188  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  35.83 
 
 
317 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  35.83 
 
 
317 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.16 
 
 
317 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  37.9 
 
 
316 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  33.23 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  37.61 
 
 
328 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.39 
 
 
339 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  38.6 
 
 
313 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  36.28 
 
 
334 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  36.39 
 
 
325 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  34.77 
 
 
306 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  36.14 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  32.79 
 
 
307 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  35.74 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  36.77 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 
312 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  35.51 
 
 
316 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  35.24 
 
 
316 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  35.24 
 
 
316 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  35.24 
 
 
316 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  33.33 
 
 
340 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  31.17 
 
 
335 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  32.47 
 
 
302 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  31.43 
 
 
322 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  33.33 
 
 
359 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.21 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.28 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  39.45 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  30.93 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.93 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.08 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.32 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  29.91 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  26.27 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.29 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  41 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.14 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  31.69 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  35.61 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  39.05 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.94 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  31.37 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  31.37 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  31.37 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  27.16 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  37.62 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  26.3 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  37.62 
 
 
308 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  26.3 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  26.3 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  27.37 
 
 
278 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  34.65 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08451  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
389 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.998822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.68 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  30.77 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.9 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.5 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  35 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  24.75 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  26.79 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4450  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.94 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.743649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 
3337 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.8 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>