More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3064 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  100 
 
 		 325 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  78.88 
 
 		 328 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  62.86 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  59.11 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  54.63 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  49.84 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  45.86 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  43.99 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  46.01 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  41.48 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  43.3 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  43.41 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  40.98 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  42.55 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.56 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  41.07 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  42.45 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  40.56 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  38.59 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40.87 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  36.81 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  38.84 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  38.98 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  38.98 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.23 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  38.66 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  38.66 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  38.66 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  38.34 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  38.87 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  37.42 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  38.99 
 
 		 319 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  39.21 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  39.07 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  35.36 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  39.07 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  39.07 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  39.07 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  34.59 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  34.19 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  36.89 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  36.39 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  36.39 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  36.39 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  36.39 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.19 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  36.62 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.49 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  31.73 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.48 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  28.68 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.68 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.21 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  28.02 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.78 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  29.49 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.12 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  27.98 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.86 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  32.65 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  26.29 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  25.33 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  25.33 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  25.33 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  26.8 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  26.8 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  26.37 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  26.35 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  26.86 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.42 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  33.55 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.7 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  31.76 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  27.72 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  31.76 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.54 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.71 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.11 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  26.58 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  33.58 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.47 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.33 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.86 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.86 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.71 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  27.35 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  26.34 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  25.61 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>