More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0958 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  100 
 
 		 361 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  85.2 
 
 		 360 aa  621  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  33.11 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  30.22 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.25 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.31 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.12 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.44 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.38 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.9 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.29 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  32.2 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.02 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.74 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.05 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.64 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  29.71 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.59 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.44 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.83 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  25.59 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.94 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.94 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.79 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.79 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.79 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  24.63 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.27 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.7 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.01 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  33.14 
 
 		 439 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  24.74 
 
 		 333 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  25.47 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 		 3337 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.64 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.15 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.51 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.8 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.37 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.97 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  28.01 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  23.97 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.3 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  23.98 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  23.88 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  32.29 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  27.3 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.79 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.35 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  35.29 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  28 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.34 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.03 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  25.18 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  27.74 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.48 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  27.16 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  26.03 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  27.38 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  26.03 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.5 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  29.83 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.18 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  26.59 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  27.7 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  27.83 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.59 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.05 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  25.6 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  28.9 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.38 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.42 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  24.76 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  28.43 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  26.65 
 
 		 734 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  35.46 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.41 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  26.1 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.39 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  28.72 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  28.09 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>