More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5748 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  100 
 
 
340 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  32.89 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  32.21 
 
 
361 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 
374 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  30.89 
 
 
328 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.84 
 
 
352 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.38 
 
 
365 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 
362 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.31 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  27.3 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.28 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.33 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  27.78 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  25.44 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.56 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.79 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.81 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.37 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  30.1 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.07 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.07 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.26 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  30.93 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.65 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.73 
 
 
439 aa  89  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 
366 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.8 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  30.5 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.29 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.32 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.32 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  28.66 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  27.32 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.81 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  33.7 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  29 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  24.24 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  29.78 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.87 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  26.82 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  25.64 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  27.22 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.19 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.19 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.48 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  33.74 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  34.15 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  34.31 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  27.22 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.77 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  36.13 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.57 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  25.08 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  26.79 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  43.01 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  43.01 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  36.07 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.17 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  37.07 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  36.09 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.97 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.09 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  35.29 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.38 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  27.25 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  30.11 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.1 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  32.75 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  24.32 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.75 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.31 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  33.54 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.44 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.25 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.02 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  34.32 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.33 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  27.92 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  34.45 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  24.71 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.3 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  29.41 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  27.45 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>