More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1675 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  100 
 
 		 362 aa  747    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.15 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.25 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.74 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.77 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.62 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  27.59 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.52 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  23.89 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.47 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.3 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.38 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  24.64 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.04 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  22.16 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.5 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  23.62 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.26 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25.38 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.05 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  23.3 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  23.89 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  23.89 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  23.3 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.77 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  23.3 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.05 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.29 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  27.73 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  23.58 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24.05 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  23.77 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.77 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  35.51 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  22.71 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.98 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  23.8 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  26.09 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  22.77 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.46 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  22.19 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  23.01 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  26.11 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  25.45 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.55 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  23.86 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.64 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  23.14 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  24.18 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  40 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  24.27 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  21.88 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.17 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  22.99 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  24.18 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.47 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  31.62 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  24.78 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.5 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  23.24 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  21.14 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  21.34 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.61 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.7 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.85 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  25.36 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  22.5 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  22.5 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  22.5 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  22.5 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  34.4 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  23.33 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  22.03 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  23.77 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  23.77 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.86 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  26.38 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.31 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  23.64 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  27.78 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  32.26 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.63 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  21.1 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  23.94 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  24.53 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  31.75 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  23.12 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>