More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8163 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
386 aa  801    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  68.87 
 
 
402 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.49 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.95 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  33.51 
 
 
415 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  34.6 
 
 
439 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  34.06 
 
 
436 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  34.06 
 
 
436 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  34.06 
 
 
436 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  33.42 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.65 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.25 
 
 
362 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
379 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 
362 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
372 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.34 
 
 
377 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.29 
 
 
383 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.46 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.05 
 
 
365 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  27.27 
 
 
382 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 
374 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  27.84 
 
 
384 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  27.84 
 
 
384 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  29.81 
 
 
384 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  29.77 
 
 
358 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  30.27 
 
 
358 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.89 
 
 
363 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  28.37 
 
 
354 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  25.35 
 
 
352 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
352 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.85 
 
 
347 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.09 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.23 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.3 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.17 
 
 
347 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.65 
 
 
354 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.98 
 
 
329 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.35 
 
 
353 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.08 
 
 
360 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.75 
 
 
327 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.57 
 
 
346 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.07 
 
 
331 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 
343 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 
351 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.15 
 
 
347 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 
355 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.25 
 
 
346 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.53 
 
 
346 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.25 
 
 
346 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.97 
 
 
346 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 
351 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.38 
 
 
361 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.65 
 
 
371 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  25.82 
 
 
352 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  25.54 
 
 
351 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.15 
 
 
345 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 
346 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 
356 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.15 
 
 
345 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  25.54 
 
 
351 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  25.54 
 
 
351 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.29 
 
 
346 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 
376 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  27.95 
 
 
352 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  28.65 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  24.73 
 
 
351 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  25 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.13 
 
 
330 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.03 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.11 
 
 
341 aa  93.6  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  24.59 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  24.43 
 
 
345 aa  92.8  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  26.8 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  26.2 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.01 
 
 
345 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  25.99 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  25.27 
 
 
352 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.27 
 
 
333 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  27.58 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  27.37 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.92 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  24.64 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  32.99 
 
 
338 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 
345 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  26.67 
 
 
340 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  24.92 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  33.83 
 
 
348 aa  86.3  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  24.5 
 
 
344 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  32.14 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  27.25 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  27.25 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  27.06 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  26.61 
 
 
3337 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  25.85 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  31.61 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.87 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>