More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2071 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  100 
 
 		 360 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  85.2 
 
 		 361 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.97 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  31.19 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.91 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  27.04 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.08 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  32.12 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  27.02 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.36 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.36 
 
 		 402 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.36 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.4 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.93 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  32.26 
 
 		 308 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  28.08 
 
 		 324 aa  96.3  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  29.41 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  33.94 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  33.94 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.02 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.58 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.46 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.58 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.58 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  26.98 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.26 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.81 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.91 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  32.02 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.71 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.51 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.54 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28.4 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.38 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.91 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  26.61 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.14 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.66 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.48 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  31.34 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  24.4 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.71 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  31.72 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  26.49 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  30.05 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  26.75 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  24.53 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.82 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.39 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.69 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  28.26 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  28.32 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.51 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  27.48 
 
 		 3337 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  23.69 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.75 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.57 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  25.57 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.57 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  25.68 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.32 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.99 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.15 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  27.03 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  22.82 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  35.43 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.03 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  25.41 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  27.3 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  26.91 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  26.46 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.46 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.42 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  26.96 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  25.9 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.14 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  29.28 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  32.18 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  26.17 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  27.47 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.89 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.34 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.34 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  28.57 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  24.58 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>