More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2497 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  100 
 
 		 322 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  65.73 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1881  luciferase family oxidoreductase, group 1  52.16 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797974  normal  0.396374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0991  luciferase family protein  50.78 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.76 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3717  luciferase-like protein  47.22 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0129729  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2484  Luciferase-like monooxygenase  44.62 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.38 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  42.99 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.4 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  42.17 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  40 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  40.8 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  40.19 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.02 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  39.62 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  39.68 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  40.58 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  40.81 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.25 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  41.4 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  38.98 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  40.38 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  41.94 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  41.14 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  41.08 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  39.55 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  37.7 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  41.32 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  37.7 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  38.02 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  38.02 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  38.85 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  41.32 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  38.02 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  40.26 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  38.02 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  38.91 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  38.14 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  41.21 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  41.23 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  37.38 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  44.04 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  41.3 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  36.74 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  44.22 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  40.13 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  40.13 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  40.13 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  40.13 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  41.3 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  40.13 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  37.82 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  42.17 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  42.18 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  41.8 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  41.35 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  40.99 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  38.22 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  38.66 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  39.02 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  37.9 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  38.22 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  37.58 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0403  luciferase family protein  39.57 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  41.43 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  40.13 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  37.26 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  38.1 
 
 		 331 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  37.26 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  37.85 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  39.68 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  37.26 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  37.9 
 
 		 339 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.19 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  37.62 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  35.96 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3168  Luciferase-like monooxygenase  39.81 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022077 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5145  luciferase family protein  40.06 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  32.91 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  37.58 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>