More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0991 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0991  luciferase family protein  100 
 
 
323 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000148134  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.27 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  50.98 
 
 
322 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1881  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.3 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797974  normal  0.396374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.73 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2484  Luciferase-like monooxygenase  45.23 
 
 
332 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3717  luciferase-like protein  46.27 
 
 
342 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0129729  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  41.94 
 
 
340 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  40.6 
 
 
355 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  37.01 
 
 
326 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  36.72 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  39.17 
 
 
327 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  38.46 
 
 
331 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  39.04 
 
 
356 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  35.93 
 
 
326 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  41.9 
 
 
346 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 
328 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  35.95 
 
 
338 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  36.56 
 
 
338 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  38.85 
 
 
327 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  40.88 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  36.7 
 
 
338 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.1 
 
 
340 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  38.36 
 
 
351 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.82 
 
 
357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  41.05 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  38.69 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  39.53 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  39.33 
 
 
355 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  35.35 
 
 
335 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  38.05 
 
 
332 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  38.54 
 
 
353 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  38.05 
 
 
332 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  37.74 
 
 
332 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.34 
 
 
341 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  38.94 
 
 
347 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  38.61 
 
 
331 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.34 
 
 
343 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.72 
 
 
338 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
332 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  34.39 
 
 
335 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  36.25 
 
 
336 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  35.24 
 
 
335 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  34.39 
 
 
335 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  34.38 
 
 
335 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
336 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  34.38 
 
 
335 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
336 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
352 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  37.46 
 
 
424 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  37.31 
 
 
335 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  36.79 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  36.62 
 
 
335 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  38.1 
 
 
337 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  34.38 
 
 
335 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  36.62 
 
 
335 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  36.08 
 
 
335 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  37.62 
 
 
397 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  35.76 
 
 
336 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  35.76 
 
 
331 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  34.73 
 
 
331 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  36.54 
 
 
349 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.49 
 
 
355 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  36.31 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  36.31 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  37.38 
 
 
338 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  36.48 
 
 
332 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  36.48 
 
 
332 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  34.71 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  34.85 
 
 
339 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  34.08 
 
 
339 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.33 
 
 
312 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  35.08 
 
 
339 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  34.05 
 
 
338 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  34.71 
 
 
341 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  33.76 
 
 
335 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  33.94 
 
 
328 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  34.62 
 
 
333 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  33.76 
 
 
335 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  35.93 
 
 
339 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  35.53 
 
 
337 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  33.76 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  35.58 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  36.34 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  35.9 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.43 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  34.59 
 
 
347 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  31.29 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  33.44 
 
 
335 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  32.23 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>