More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0403 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0403  luciferase family protein  100 
 
 		 328 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  62.77 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  61.3 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  61.35 
 
 		 340 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  61.18 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  61.18 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  59.32 
 
 		 327 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  57.54 
 
 		 343 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  56 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  58.44 
 
 		 331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  56.39 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  59.94 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  59.94 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  59.94 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  59.32 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  56.07 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  54.21 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  58.7 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  56.39 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  53.89 
 
 		 339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  59.06 
 
 		 343 aa  341  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  56.62 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  55.9 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  56.35 
 
 		 331 aa  340  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  58.75 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  56.83 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  58.7 
 
 		 332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  58.7 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  58.64 
 
 		 336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  58.64 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  55.45 
 
 		 338 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  58.28 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  56.07 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  57.81 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  55.28 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  53.42 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  54.97 
 
 		 339 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  54.66 
 
 		 336 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  56 
 
 		 335 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  54.97 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  52.63 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  53.87 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  56 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  53.07 
 
 		 328 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  54.01 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  53.73 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.4 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  52.76 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  53.42 
 
 		 351 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  53.42 
 
 		 351 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  52.65 
 
 		 341 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  54.21 
 
 		 343 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  55.52 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.58 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  55.62 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  53.58 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  52.81 
 
 		 353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  53.73 
 
 		 333 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  51.69 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  51.55 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  52.6 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  50 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  50.31 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  50.31 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  50.31 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  50.15 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  50.31 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0210  luciferase-like  52.6 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  50.15 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  49.69 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  50 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  49.69 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  52.2 
 
 		 361 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  53.58 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  55.21 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  48.93 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  48.6 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  48.29 
 
 		 347 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  47.22 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  48.62 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  50.62 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  49.84 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  49.69 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  52.17 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5124  luciferase family protein  50.31 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  50.61 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  50.62 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  48.29 
 
 		 334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  47.85 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>