More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03171 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  100 
 
 		 324 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  58.31 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  57.99 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  58.13 
 
 		 352 aa  362  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.99 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.48 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.88 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.62 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  35.57 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.08 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  31.58 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  34.55 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  34.55 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  37.11 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.38 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  35.93 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.19 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  27.13 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.71 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.67 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.28 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  31.71 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  32.8 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  26.27 
 
 		 421 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  33.96 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  31.71 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  34.62 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.33 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.16 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.66 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.15 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.68 
 
 		 402 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.82 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  33.54 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  24.32 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.46 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  35 
 
 		 355 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.46 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  31.05 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.46 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  34.07 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.09 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  33.96 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.42 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  30.26 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  30.1 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.47 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  29.19 
 
 		 346 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.73 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.65 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.65 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  25.2 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  30.92 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  29.04 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  31.77 
 
 		 415 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  29.18 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  29.72 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  23.48 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  30.1 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.49 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.16 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  25.82 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.42 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  31.45 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  31.45 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.63 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  30.19 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.96 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  29.18 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  33.91 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  22.36 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.71 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1469  luciferase-like  26.4 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.54 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  30.16 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  28.46 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.99 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  26.3 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25.08 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>