More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1236 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  100 
 
 
323 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  52.33 
 
 
356 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  45.76 
 
 
341 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  45.75 
 
 
334 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  28.33 
 
 
355 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  27.84 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  39.04 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.6 
 
 
353 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  27.48 
 
 
356 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  39.9 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  37.97 
 
 
327 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  33.5 
 
 
374 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  40 
 
 
354 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 
343 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  37.84 
 
 
382 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  37.06 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  35.68 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.47 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.47 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
379 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  34.31 
 
 
341 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  34.52 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.62 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  24.24 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.49 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  38.07 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  27.35 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  26.25 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  31.18 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.74 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  31.89 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.12 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.7 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.87 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  27.81 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.54 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  38.82 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  36.14 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.79 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.79 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  31.35 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  29.26 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  31.05 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.9 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  32.09 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  42.37 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.95 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.63 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  31.18 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  34.34 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  33.07 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  31.48 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.79 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.27 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  27.15 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  32.24 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  31.02 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  45.54 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  40.94 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  31.52 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  31.61 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  39.13 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  35.54 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.82 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  31.52 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.57 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  31.22 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  30.43 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.65 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.15 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.67 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  25.75 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  31.94 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  25.48 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.58 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.28 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  32.92 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.28 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  43.88 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.28 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  39.64 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  28.7 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  32.77 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  37.96 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  34.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  31.55 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>