More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0203 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  100 
 
 		 362 aa  750    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  62.04 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  58.56 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  42.42 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  38.48 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  38.08 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  27.91 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  32.95 
 
 		 396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  28.24 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  32.95 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  32.95 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  28.69 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  27.6 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  31.27 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  31.54 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  29.2 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  32.35 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  27.67 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.44 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.64 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.5 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.64 
 
 		 347 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.59 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  24.86 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.57 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.97 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.82 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.11 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  31.33 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  33.15 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.06 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  25 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  23.9 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.63 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.04 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.16 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  25.85 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  23.5 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.21 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  23.46 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.21 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.21 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.75 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.26 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  37.04 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  24.66 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.33 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.71 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  27.63 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.37 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  36.75 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  31.87 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  34.71 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.46 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  35.04 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  34.75 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.66 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  32.47 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  32.47 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  25.28 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  32.47 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  24.2 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  34.51 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.26 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.98 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  35.54 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.24 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.32 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27.83 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.76 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.76 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.73 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.76 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.46 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.56 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  27.41 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  29.12 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  40.22 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  40.22 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  40.22 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.89 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  24.44 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>