More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2168 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 338 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  85.88 
 
 		 340 aa  604  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  85.88 
 
 		 340 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  86.18 
 
 		 340 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  84.41 
 
 		 341 aa  597  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  84.41 
 
 		 340 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  82.94 
 
 		 344 aa  590  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  83.24 
 
 		 341 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  83.24 
 
 		 340 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  82.35 
 
 		 340 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  82.35 
 
 		 340 aa  581  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  84.12 
 
 		 348 aa  577  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  79.71 
 
 		 340 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  80.29 
 
 		 344 aa  567  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  76.47 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  74.85 
 
 		 338 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  73.53 
 
 		 340 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  75.22 
 
 		 340 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  74.41 
 
 		 340 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  74.78 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  73.53 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.6 
 
 		 340 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  61.52 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  60.29 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  58.88 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  60.82 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.1 
 
 		 354 aa  358  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  48.69 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.67 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  49.22 
 
 		 258 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  34.11 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  31.99 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.87 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  34.42 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  31.1 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.41 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  30.23 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  29.66 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.24 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  28.7 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  30.48 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  31.82 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  31.86 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.4 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  32.52 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.86 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.93 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  35.32 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.31 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.43 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.16 
 
 		 127 aa  87  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.09 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.38 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.38 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  28.14 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.61 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  41.67 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.37 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.29 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  27 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.69 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.96 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.05 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.29 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  41.24 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  28.35 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  43.02 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  37.89 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  38.46 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.37 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  37.07 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  32.7 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  43.53 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  26.99 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.24 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.52 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  28.68 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  24.62 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.39 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.9 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.26 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.61 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.95 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  31.91 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  28.01 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.15 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>