More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5567 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
344 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  72.07 
 
 
359 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  59.52 
 
 
346 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  56.59 
 
 
372 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  57.88 
 
 
331 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  59.57 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  57.81 
 
 
342 aa  342  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
341 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  46.18 
 
 
337 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  45.24 
 
 
350 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  45.88 
 
 
338 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  45.24 
 
 
341 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  44.71 
 
 
338 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  34.21 
 
 
381 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
340 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  29.46 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  30.34 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  30.06 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  28.61 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  27.38 
 
 
340 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  30.95 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.85 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  31.03 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30.17 
 
 
344 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  30.68 
 
 
348 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.71 
 
 
354 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  28.25 
 
 
341 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.84 
 
 
340 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  28.7 
 
 
340 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  29.49 
 
 
340 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.66 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  27.56 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 
341 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  30.06 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.55 
 
 
361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.79 
 
 
365 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  28.45 
 
 
361 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.25 
 
 
347 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.29 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.51 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.5 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.91 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.13 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  31.17 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.11 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.21 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  34.97 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  33.11 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  29.9 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.98 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.27 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.53 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.56 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.95 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  43.18 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  29.27 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25.19 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  29.27 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  39.62 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  31.19 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  34.26 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  32.42 
 
 
734 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  29.73 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.11 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  37.61 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.62 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  40.91 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  39.53 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  35.17 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.33 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.95 
 
 
334 aa  62.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  35.96 
 
 
380 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  25.53 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.89 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.83 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  39.42 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.96 
 
 
439 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.35 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.27 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.9 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.91 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  33.98 
 
 
396 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  33.98 
 
 
396 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>