More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0230 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  100 
 
 		 359 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  55.18 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  59.68 
 
 		 319 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  54.63 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  54.37 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  53.9 
 
 		 328 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  43.58 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  45.43 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  40.81 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  44.48 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  44.2 
 
 		 327 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  43.13 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  42.99 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  40.76 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  40.98 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  43.59 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  42.6 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  42.17 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  39.27 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  37.62 
 
 		 316 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  42.31 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  40.88 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  40.88 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  40.57 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  40.88 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  40.57 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  40.85 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  40.57 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  42.96 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  42.96 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  42.96 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  42.21 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  42.21 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  35.97 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  35.31 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.28 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  35.14 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  37.96 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  37.54 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  36.87 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  38.05 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  35.87 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  35.87 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  35.87 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  34.41 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  34.49 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.22 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.22 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.51 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 288 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.03 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  33.15 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.09 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.38 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.38 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.38 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.05 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  41.13 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  37.1 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30.56 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  29.1 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.81 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.33 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  34.75 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.26 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.74 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.35 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.91 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.54 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  27.24 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.63 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.06 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.61 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  36.57 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.79 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.14 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.65 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  24.23 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.72 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  36.23 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  37.14 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.23 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.25 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.8 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  40.66 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  26.85 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>