More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4910 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4910  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 372 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  42.78 
 
 		 408 aa  276  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  45.15 
 
 		 1541 aa  268  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  40.23 
 
 		 3337 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  42.33 
 
 		 1519 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.33 
 
 		 6889 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 1107 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  42.99 
 
 		 4483 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  40.25 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 		 377 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.08 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.76 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.62 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.66 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.5 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.5 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.53 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.79 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.18 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.91 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  25.58 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.1 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.22 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  31.89 
 
 		 734 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  34.13 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28.74 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.84 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.56 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  36.62 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  23.87 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.25 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  30.84 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  31.73 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.18 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  36.99 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.28 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.58 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  32.87 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  35.37 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.55 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  33.33 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.26 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  22.46 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.4 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.85 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.76 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.88 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  34.03 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.89 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  25.7 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.87 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.44 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  39.39 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.9 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  23.21 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  24.84 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  22.65 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.16 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.57 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.58 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  34.17 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  34.53 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  29.56 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.62 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  33.16 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  24.85 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  33.5 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00310  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.3 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  22.42 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  23.83 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.89 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  28.18 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.9 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  33.86 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  29.14 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  33.64 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  35.17 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>