45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13212 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13212  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.845134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  65.1 
 
 
338 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  65.1 
 
 
338 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  65.1 
 
 
338 aa  173  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  63.33 
 
 
337 aa  170  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  61.07 
 
 
341 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  38.62 
 
 
341 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  36.49 
 
 
345 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  36.55 
 
 
342 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  36.55 
 
 
341 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  36.64 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  41.28 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  41.28 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  40.37 
 
 
364 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  41.58 
 
 
329 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  40.37 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  41.12 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  32.41 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  35.85 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  32.14 
 
 
348 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  35.71 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  36.84 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  35.71 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  35.71 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  33.33 
 
 
335 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  34.55 
 
 
340 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
333 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.69 
 
 
349 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.46 
 
 
333 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  35.71 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  31.07 
 
 
284 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  32.14 
 
 
327 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.75 
 
 
298 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  27.52 
 
 
357 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  32.18 
 
 
304 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.96 
 
 
341 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.17 
 
 
344 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  34.52 
 
 
331 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.36 
 
 
334 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 
274 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  30.97 
 
 
292 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.61 
 
 
302 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.76 
 
 
327 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>