More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1517 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  67.06 
 
 
251 aa  362  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5942  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  60.56 
 
 
252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  57.37 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  57.03 
 
 
264 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  57.03 
 
 
264 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  57.03 
 
 
264 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.57 
 
 
262 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  57.36 
 
 
266 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0643  hypothetical protein  57.2 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6045  hypothetical protein  57.2 
 
 
265 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0597189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  55.47 
 
 
269 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  55.34 
 
 
256 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10043  oxidoreductase  56.13 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  54.94 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4922  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  58.91 
 
 
259 aa  271  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.550602  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2902  hypothetical protein  52.92 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0865199  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.97 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0190  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.59 
 
 
264 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11520  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.2 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2629  hypothetical protein  43.23 
 
 
269 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2673  hypothetical protein  43.23 
 
 
269 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2657  hypothetical protein  43.23 
 
 
269 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2936  hypothetical protein  42.7 
 
 
269 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767256  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  40.29 
 
 
282 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  40.58 
 
 
281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  40.99 
 
 
321 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.68 
 
 
290 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  41.41 
 
 
332 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  37.4 
 
 
286 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  35.06 
 
 
287 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  40.38 
 
 
330 aa  148  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  38.91 
 
 
343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40 
 
 
328 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  39.81 
 
 
309 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  39.81 
 
 
309 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  39.81 
 
 
309 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  34.3 
 
 
285 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  34.3 
 
 
285 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  34.19 
 
 
285 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  37.17 
 
 
338 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  37.17 
 
 
338 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
323 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  35.42 
 
 
309 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 
287 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  37.17 
 
 
338 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  37.44 
 
 
332 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  38.36 
 
 
335 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  37.95 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  37.81 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  36.57 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  39.62 
 
 
330 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 
316 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  39.8 
 
 
338 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  37.61 
 
 
330 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  37.31 
 
 
328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.97 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
330 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  39.35 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.56 
 
 
310 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  36.32 
 
 
313 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  36.32 
 
 
313 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  36.86 
 
 
309 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.8 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  36.71 
 
 
328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.18 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  35.9 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  37.23 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  36.52 
 
 
300 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  36.09 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  36.09 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  34.91 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  38.74 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.78 
 
 
292 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  33.45 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  34.1 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  36.29 
 
 
288 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
290 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
288 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  35.32 
 
 
294 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  34.44 
 
 
298 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  35.47 
 
 
307 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  32.59 
 
 
314 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
314 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 
307 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 
311 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  31.06 
 
 
293 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  29.35 
 
 
347 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  33.8 
 
 
353 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.78 
 
 
306 aa  95.1  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
320 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  30.04 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 
308 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  31.43 
 
 
316 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  30.33 
 
 
316 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.23 
 
 
309 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>