More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5150 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
309 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  73.1 
 
 
296 aa  437  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  51.7 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5146  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36869  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.07 
 
 
285 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  30.16 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.34 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.2 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.91 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.7 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  24.17 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.23 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.3 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  29.84 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1135  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
251 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1162  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.53 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0158774  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  27.83 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.5 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.7 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.7 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.04 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  29.03 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.43 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.3 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.7 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.7 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.38 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.36 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.59 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.44 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.37 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.84 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  25.82 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>