More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2416 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 438 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  55.96 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  55.47 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  56.2 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  55.47 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  54.74 
 
 		 443 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  54.99 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  54.99 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  54.5 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  54.26 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  55.29 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  52.16 
 
 		 438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  54.01 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  53.79 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  51.18 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  50.96 
 
 		 437 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  50.97 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  50.96 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  51.4 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  50.72 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  50.72 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  52.8 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  50.72 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  50.72 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  50.72 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  51.16 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  50.59 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  54.01 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  54.26 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  51.12 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  53.28 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  50.49 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  47.72 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  47.43 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  46.88 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  47.12 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  47.12 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  46.8 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  47.12 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  46.8 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  47.12 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  46.8 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  46.88 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  47.12 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  47.6 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  43.9 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  47.12 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  47.49 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  47.03 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  46.8 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  46.8 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  47.88 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  50.39 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  47.36 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  43.24 
 
 		 437 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  42.75 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.72 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  40.37 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  41.79 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0517  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.75 
 
 		 421 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.946656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  39.82 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  40.8 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.01 
 
 		 444 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  41.54 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.03 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.41 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 447 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.64 
 
 		 428 aa  296  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  37.41 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  37.41 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  39.58 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.29 
 
 		 444 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0995  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 465 aa  293  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  39.01 
 
 		 439 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.67 
 
 		 448 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  38.05 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  38 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  41.73 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  40.62 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  36.95 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.19 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  40.46 
 
 		 442 aa  288  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  38 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.99 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  37.65 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>