More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2035 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 466 aa  931    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4398  sodium:dicarboxylate symporter  76.89 
 
 		 458 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4176  sodium:dicarboxylate symporter  77.11 
 
 		 458 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3595  sodium:dicarboxylate symporter  73.62 
 
 		 464 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4242  sodium:dicarboxylate symporter  77.11 
 
 		 458 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4696  sodium:dicarboxylate symporter  78.1 
 
 		 461 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1323  sodium:dicarboxylate symporter  72.23 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2257  sodium:dicarboxylate symporter  67.11 
 
 		 480 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  66.89 
 
 		 456 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12470  C4-dicarboxylate-transport transmembrane protein dctA  70.31 
 
 		 491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000112965  normal  0.468054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25740  Na+/H+ dicarboxylate symporter  64.55 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1530  sodium:dicarboxylate symporter  64.83 
 
 		 447 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3870  sodium:dicarboxylate symporter  64.86 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137849  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1530  sodium:dicarboxylate symporter  62.92 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000123662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14090  Na+/H+ dicarboxylate symporter  59.52 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1151  sodium:dicarboxylate symporter  60.75 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  50.61 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.71 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  47.71 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  47.71 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.73 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.18 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  47.32 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.41 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.26 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.41 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.71 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.88 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.26 
 
 		 436 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.18 
 
 		 440 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  49.31 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.67 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.27 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.88 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.79 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.94 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.26 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.07 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.9 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  49.16 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  44.95 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5694  sodium:dicarboxylate symporter  47.29 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  48.12 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  49.39 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  48.37 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.94 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.94 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.07 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.31 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.94 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.02 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  48.96 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3546  sodium:dicarboxylate symporter  46.94 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.06 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.47 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.06 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  49.64 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.24 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  47.11 
 
 		 448 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.12 
 
 		 439 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.69 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  44.76 
 
 		 437 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.07 
 
 		 447 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  45.73 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  48.77 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.07 
 
 		 452 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1507  sodium:dicarboxylate symporter  45.33 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.07 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02396  C4-dicarboxylate transporter DctA  49.52 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.65 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.96 
 
 		 447 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  47.26 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.02 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  47.72 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  45.34 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  44.14 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 		 449 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.63 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  44.68 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  45.77 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.04 
 
 		 428 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  45.52 
 
 		 442 aa  342  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  44.68 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.08 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  43.9 
 
 		 449 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.95 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>