More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4639 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4934  sodium:dicarboxylate symporter  99.31 
 
 
432 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4551  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
432 aa  846    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4639  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
432 aa  846    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  32.61 
 
 
433 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  34.24 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  33.5 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  33 
 
 
424 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.23 
 
 
449 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 
432 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  32.94 
 
 
430 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  34.11 
 
 
442 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
444 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  33.68 
 
 
436 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
444 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
444 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 
437 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
444 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 
437 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  31.33 
 
 
449 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.69 
 
 
445 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
416 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
416 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
436 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  33.68 
 
 
440 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 
408 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 
416 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
440 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
440 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  32.26 
 
 
408 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  32.52 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.39 
 
 
436 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.46 
 
 
437 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  32.45 
 
 
417 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  33.42 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  30.77 
 
 
434 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  31.13 
 
 
409 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  30.85 
 
 
439 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.81 
 
 
445 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  31.57 
 
 
408 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  31.41 
 
 
425 aa  170  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  30.88 
 
 
409 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  31.6 
 
 
411 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  31.4 
 
 
410 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  32.89 
 
 
411 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  30.88 
 
 
409 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  31.65 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  31.78 
 
 
416 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  32.62 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  31.19 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  32.44 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  30.48 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  29.4 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  31.41 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  29.15 
 
 
434 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  31.42 
 
 
419 aa  163  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  30.81 
 
 
447 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  29.95 
 
 
433 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  32.2 
 
 
441 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  28.85 
 
 
430 aa  160  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  31.71 
 
 
419 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.28 
 
 
417 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  32.28 
 
 
402 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  32.43 
 
 
457 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  31.39 
 
 
438 aa  156  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 
425 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.82 
 
 
440 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  30.05 
 
 
409 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  30.54 
 
 
413 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  28.39 
 
 
425 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
414 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  29.13 
 
 
451 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  32.72 
 
 
424 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 
424 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  30.3 
 
 
457 aa  150  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 
424 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  30.05 
 
 
457 aa  149  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  31.07 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  28.88 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
442 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  30.62 
 
 
419 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  30.07 
 
 
442 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  27.11 
 
 
420 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  29.88 
 
 
443 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  31.5 
 
 
405 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  29.54 
 
 
442 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  29.07 
 
 
444 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 
436 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  28.67 
 
 
438 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>