More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1380 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  97.25 
 
 		 435 aa  829    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  89.02 
 
 		 429 aa  712    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  87.56 
 
 		 433 aa  704    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 436 aa  876    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2657  sodium:dicarboxylate symporter  75.89 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2374  sodium:dicarboxylate symporter  76.87 
 
 		 434 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  67.78 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1780  sodium:dicarboxylate symporter  67.61 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2104  sodium:dicarboxylate symporter  66.35 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  57.74 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  57.87 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  56.81 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  56.07 
 
 		 490 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  56.94 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  56.94 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  56.09 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1122  sodium:dicarboxylate symporter  56.19 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0909737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  56.12 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2667  Sodium:dicarboxylate symporter  57.14 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.02 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  59.02 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2248  sodium:dicarboxylate symporter  56.05 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.755377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  57.14 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  52.46 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6432  sodium:dicarboxylate symporter  54.21 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6735  sodium:dicarboxylate symporter  55.96 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4600  sodium:dicarboxylate symporter  52.9 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0437435  normal  0.0256867 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  51.89 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5075  sodium:dicarboxylate symporter  59.02 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  53.58 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5785  sodium:dicarboxylate symporter  59.02 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.9943 
 
 
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NC_012791  Vapar_1173  sodium:dicarboxylate symporter  55.77 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0590  sodium:dicarboxylate symporter  54.99 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4393  sodium:dicarboxylate symporter  59.02 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5637  sodium:dicarboxylate symporter  56.03 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.315095  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  54.29 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1045  sodium:dicarboxylate symporter  54.57 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5947  sodium:dicarboxylate symporter  52.67 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.214445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3614  sodium:dicarboxylate symporter  54.85 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  53.38 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
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NC_008392  Bamb_6250  sodium:dicarboxylate symporter  52.44 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5530  sodium:dicarboxylate symporter  54.61 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26826  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4753  sodium:dicarboxylate symporter  54.85 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573078  normal  0.247948 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  56.72 
 
 		 458 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  49.3 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6216  sodium:dicarboxylate symporter  53.44 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5943  sodium:dicarboxylate symporter  52.2 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1652  sodium:dicarboxylate symporter  49.89 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_2463  sodium:dicarboxylate symporter  52.06 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5606  sodium:dicarboxylate symporter  53.66 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5970  sodium:dicarboxylate symporter  53.66 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153682  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  50.96 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6470  sodium:dicarboxylate symporter  53.41 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.040423  normal  0.150029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1745  sodium:dicarboxylate symporter  51.09 
 
 		 412 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  50.49 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2629  sodium:dicarboxylate symporter  52.21 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  49.16 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  49.16 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4575  sodium:dicarboxylate symporter  47.28 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4373  sodium:dicarboxylate symporter  46.7 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3545  sodium:dicarboxylate symporter  47.51 
 
 		 433 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1737  sodium:dicarboxylate symporter  46.21 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4991  sodium:dicarboxylate symporter  39.29 
 
 		 466 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2088  sodium--dicarboxylate symporter  41.78 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.808142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  39.24 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  39.24 
 
 		 437 aa  286  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  39.24 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  38 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  38.3 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  38.3 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  38.3 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  38.3 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  38.3 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  35.81 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  37.41 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  40.87 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  38.94 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  39.41 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  40.14 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  38.97 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  40.41 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
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NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.09 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  38.82 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.53 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  38.5 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.95 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.5 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  38.85 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  38.5 
 
 		 423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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