36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1842 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.08 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  31.64 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  24.88 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  28.44 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.43 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  28.86 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  24.12 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.01 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  23.74 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.4 
 
 
943 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  24.57 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.36 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.75 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  26.24 
 
 
889 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  26.92 
 
 
190 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.28 
 
 
800 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.28 
 
 
800 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.92 
 
 
800 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.53 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  28.3 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  35.78 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.3 
 
 
950 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 
790 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.85 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3231  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
916 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.39 
 
 
199 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1706  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.76 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  23.85 
 
 
891 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.05 
 
 
967 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.51 
 
 
932 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.32 
 
 
943 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.18 
 
 
938 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  22.97 
 
 
229 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  28.83 
 
 
189 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>